Résilience à une nouvelle pandémie

[christophe 38]

yop

 

je sais bien qu'on fait dire n'importe quoi aux chiffres (ou que l'on peut faire dire..), mais, je m'interroge un petit peu :

la répartition mondiale avant hier : https://fr.statista.com/statistiques/1091585/morts-infections-coronavirus-monde/

aucun cas, aucun symptome en Afrique, alors que les Africains vont en Chine pour acheter des containers de marchandises et que de tres nombreux chinois sont en Afrique.

Ils sont imunisés, en Afrique ?

ou ne sont pas capable de les détecter ?

edit : ou ne veulent pas paniquer leurs populations avec des cas qu'ils ne peuvent/savent traiter ????

Modifié le 23 février 2020 par christophe 38

[Akhilleus]

Il y a 7 heures, christophe 38 a dit :

yop

 

je sais bien qu'on fait dire n'importe quoi aux chiffres (ou que l'on peut faire dire..), mais, je m'interroge un petit peu :

la répartition mondiale avant hier : https://fr.statista.com/statistiques/1091585/morts-infections-coronavirus-monde/

aucun cas, aucun symptome en Afrique, alors que les Africains vont en Chine pour acheter des containers de marchandises et que de tres nombreux chinois sont en Afrique.

Ils sont imunisés, en Afrique ?

ou ne sont pas capable de les détecter ?

edit : ou ne veulent pas paniquer leurs populations avec des cas qu'ils ne peuvent/savent traiter ????

Il y a eu des cas suspects testés et invalidés. Après on n'est pas en condition optimale de transmission en Afrique (temperature, ensoleillement), les capacités de detection sont aussi limitées et y'a tellement de maladies infectieuses autres que des cas peuvent effectivement etre perdus dans le bruit de fond

Nb: note qu'il n'y a pas de cas en AmSUD non plus alors que de la diaspora chinoise et/ou asiatique y est aussi assez presente

[P4]

Quote

En Corée du Sud, le gouvernement a déclaré l'état d'alerte maximum alors que le pays fait face à une progression très rapide des cas de contamination. Sur la seule journée de dimanche, les autorités ont compté 169 cas portant à 602 le nombre de personnes touchées par la maladie.

Coronavirus : mises en quarantaine et fermetures de frontières se multiplient

[Henri K.]

 

[collectionneur]

Un hôpital de Taiwan a mit en service un robot stérilisateur ''unique au monde'' équipé de puissantes lampes a ultraviolet pour s'occuper des salles d'opérations a ''70 %'' - un truc que l'on pourrait copier facilement pour aider les équipes de nettoyage - et a un bus spécialisé pour les personnes fiévreuses  :

 

[rogue0]

Le 22/02/2020 à 16:47, Akhilleus a dit :

Y'a plus qu'a attendre l'arrivée des beaux jours pour espérer que ca se calme au Nord (et inversement au Sud ou on va entrer en phase hivernale)

Je croise aussi les doigts (et j'aimerais bien que Trump ait raison cette fois)...

Mais j'ai l'impression que ce nCov-2019 reste relativement contagieux même à température tempérées/estivales . (sans parler de son cousin, le virus MERS qui lui sévissait même dans le désert...)
(j'espère que la contagion baisse quand même... )

Cf les contagions régulières :

• à HK (températures ~17° même en "hiver"),
• et les cas à Singapour où il fait 26-28° toute l'année
  (bon, en intérieur, la climatisation est réglée à 20° partout là-bas, et c'est le rhume garanti... ).
  D'ailleurs, le fameux anglais passé aux Contamines, a sans doute été contaminé (sans jeu de mot) à Singapour le 24 janvier (réunion avec un chinois de Wuhan... )
  https://www.20minutes.fr/sante/2715239-20200210-coronavirus-contamines-monjoie-personnes-contaminees-developpe-forme-grave-rassurent-medecins

 

Le 22/02/2020 à 16:47, Akhilleus a dit :

A vu de nez c'est foutu pour circonscrire l'épidémie. Trop de cas qui apparaissent indépendamment dans trop de pays.

 

Le 22/02/2020 à 13:20, P4 a dit :

T'as raison il faut en profiter tant que les restaurants sont ouverts.

Coronavirus : deux morts en Italie, une dizaine de villes barricadées

Hélas, je pense que tu as raison.

A priori, vu les contagions autonomes non maîtrisées (contamination via un sports bar de Milan le 9 février), j'ai bien peur qu'on se retrouve dans la même situation en France d'ici 1-2 semaines au maximum.

[Akhilleus]

Le 24/02/2020 à 11:31, rogue0 a dit :

Je croise aussi les doigts (et j'aimerais bien que Trump ait raison cette fois)...

Mais j'ai l'impression que ce nCov-2019 reste relativement contagieux même à température tempérées/estivales . (sans parler de son cousin, le virus MERS qui lui sévissait même dans le désert...)
(j'espère que la contagion baisse quand même... )

Cf les contagions régulières :

• à HK (températures ~17° même en "hiver"),
• et les cas à Singapour où il fait 26-28° toute l'année
  (bon, en intérieur, la climatisation est réglée à 20° partout là-bas, et c'est le rhume garanti... ).
  D'ailleurs, le fameux anglais passé aux Contamines, a sans doute été contaminé (sans jeu de mot) à Singapour le 24 janvier (réunion avec un chinois de Wuhan... )
  https://www.20minutes.fr/sante/2715239-20200210-coronavirus-contamines-monjoie-personnes-contaminees-developpe-forme-grave-rassurent-medecins

 

 

Hélas, je pense que tu as raison.

A priori, vu les contagions autonomes non maîtrisées (contamination via un sports bar de Milan le 9 février), j'ai bien peur qu'on se retrouve dans la même situation en France d'ici 1-2 semaines au maximum.

Les pays que tu as cité sont encore en phase hivernale (et il est sur que les conditions artificielles de concentration de population et d'atmosphère contrôlée n'aident pas)

Les tests de viabilités montrent un viabilité virale maximale de 60 h sur une surface lisse en condition de laboratoire (72 h sur une surface poreuse)

C'est peu et assez semblable au virus de la grippe, aux rhinovirus ou aux coronavirus (bénins) humains

Après nous quand on passera en phase printanière/estivale (avec réduction mécanique du nombre de contamination) ce sera l'hémisphère sud qui sera lanterne rouge. Avec en plus beaucoup moins de moyens pour gérer le problème

[Henri K.]

Dr. Bruce Aylward de l'OMS tient une conférence de presse après avoir visité Wuhan avec une délégation de l'OMS.

Henri K.

[rogue0]

Un article de synthèse (par un médecin) sur les virus & pandémies (les stratégies de lutte, leur efficacité, les erreurs passées) et un rappel des difficultés pour créer des vaccins efficaces et sûrs.

https://www.theatlantic.com/health/archive/2020/02/covid-vaccine/607000/

Résumé :

• Comme de nombreux experts, il juge la pandémie inévitable.
   
• La contamination touchera 40-70% de la population selon les modèles.
  (EDIT: la majorité sans symptôme)
   
• Les efforts de quarantaine permettront plutôt d'atténuer le pic de l'épidémie, mais en la rallongeant...
  -> Gros avantage : ça rendra la crise plus gérable par les systèmes de santé, et donne plus de temps pour la recherche (de traitement ou d'éventuel vaccin)
   
• EDIT: Critique des quarantaines intégrales (aux effets secondaires bien plus graves que les quarantaines ciblées/partielles)
   
• Les techniques de création de vaccin ont fait de nombreux progrès, mais il faut garder en tête que la plupart des candidats vaccins échouent (pas assez efficaces, ou effets secondaires pas acceptables). -> à détailler dans d'autres posts.
  exemple : un candidat vaccin contre le SARS/SRAS qui créait des hépatites...
  http://www.cidrap.umn.edu/news-perspective/2004/12/sars-vaccine-linked-liver-damage-ferret-study
   
• Comparaison avec d'autres virus :
  le COVID n'est pas "trop mortel" pour se propager (contrairement au H5N1 mortel à 60%, qui tuait ses hôtes trop vite pour déclencher une large épidémie).
  Mais il n'a pas encore évolué comme les virus du rhume (virus "à succès" : contagieux et symptômes bénins, il ne tue pas ses hôtes).

Modifié le 26 février 2020 par rogue0
EDIT: divers ajouts

[rogue0]

Une bonne nouvelle, source en français.
La Chloroquinine a été jugée efficace pour traiter les symptômes du COVID-19, après traitement de patients chinois.
C'est un médicament déjà largement disponible, et à 10 centimes la pilule
(bon, vu les effets secondaires, ça ne sera pas utilisé en préventif, seulement en curatif)

http://french.xinhuanet.com/2020-02/05/c_138758154.htm

https://www.francetvinfo.fr/sante/maladie/coronavirus/probablement-le-traitement-le-plus-simple-pour-traiter-le-coronavirus-les-specialistes-senthousiasment-pour-la-chloroquine-deja-utilisee-contre-le-paludisme_3841305.html

Déplacé du fil "impact économique".

il y a une heure, kalligator a dit :

Je comprend pas comment un médicament prévu pour lutter contre le "plasmodium falciparium" (le microbe de la malaria) peut avoir une quelconque efficacité contre le Covid 19.
Si quelqu'un ayant des connaissances veut nous éclairer...

1)Il y a plein de médicaments avec de larges effets secondaires (positifs ou négatifs): cf l'aspirine...

2) En fait, dans l'urgence, les chercheurs avaient commencé par retester tous les médicaments existants ayant eu un effet sur d'autres coronavirus, ou virus (VIH, SRAS, MERS, grippe, etc).
(gros avantage : médicament déjà connu, validé pour les patients humains, avec effets secondaires connus)

La chloroquine avait déjà eu des effets sur le SRAS, in vitro.
Les chercheurs chinois ont prouvé l'effet sur les patients atteints de COVID-19, et donné une idée du dosage efficace.

https://vih.org/20200220/les-molecules-anti-vih-a-la-rescousse-de-lepidemie-de-covid-19/
https://francais.medscape.com/voirarticle/3605674

Pour le mécanisme d'action, je ne suis pas un sachant, je cite les chercheurs:

https://virologyj.biomedcentral.com/articles/10.1186/1743-422X-2-69

Citation

In addition to the well-known functions of chloroquine such as elevations of endosomal pH, the drug appears to interfere with terminal glycosylation of the cellular receptor, angiotensin-converting enzyme 2. This may negatively influence the virus-receptor binding and abrogate the infection, with further ramifications by the elevation of vesicular pH, resulting in the inhibition of infection and spread of SARS CoV at clinically admissible concentrations.

 

Modifié le 26 février 2020 par rogue0
grammaire

[Akhilleus]

il y a une heure, rogue0 a dit :

Une bonne nouvelle, source en français.
La Chloroquinine a été jugée efficace pour traiter les symptômes du COVID-19, après traitement de patients chinois.
C'est un médicament déjà largement disponible, et à 10 centimes la pilule
(bon, vu les effets secondaires, ça ne sera pas utilisé en préventif, seulement en curatif)

http://french.xinhuanet.com/2020-02/05/c_138758154.htm

https://www.francetvinfo.fr/sante/maladie/coronavirus/probablement-le-traitement-le-plus-simple-pour-traiter-le-coronavirus-les-specialistes-senthousiasment-pour-la-chloroquine-deja-utilisee-contre-le-paludisme_3841305.html

Déplacé du fil "impact économique".

1)Il y a plein de médicaments avec de larges effets secondaires (positifs ou négatifs): cf l'aspirine...

2) En fait, dans l'urgence, les chercheurs avaient commencé par retester tous les médicaments existants ayant eu un effet sur d'autres coronavirus, ou virus (VIH, SRAS, MERS, grippe, etc).
(gros avantage : médicament déjà connu, validé pour les patients humains, avec effets secondaires connus)

La chloroquine avait déjà eu des effets sur le SRAS, in vitro.
Les chercheurs chinois ont prouvé l'effet sur les patients atteints de COVID-19, et donné une idée du dosage efficace.

https://vih.org/20200220/les-molecules-anti-vih-a-la-rescousse-de-lepidemie-de-covid-19/
https://francais.medscape.com/voirarticle/3605674

Pour le mécanisme d'action, je ne suis pas un sachant, je cite les chercheurs:

https://virologyj.biomedcentral.com/articles/10.1186/1743-422X-2-69

 

Le lien vers l'article

https://www.jstage.jst.go.jp/article/bst/advpub/0/advpub_2020.01047/_pdf/-char/en

 

Citation

Studies revealed that it also has potential broad-spectrum antiviral activities by increasing endosomal pH required for virus/cell fusion, as well as interfering with the glycosylation of cellular receptors of SARS-CoV (6,7). The anti-viral and anti-inflammatory activities of chloroquine may account for its potent efficacy in treating patients with COVID-19 pneumonia.

Cela dit je resterais prudent, les essais ne portent que sur 100 patients (on peut imaginer 50 en cohorte témoin) .....

Mais on peut se raccrocher à ce qu'on a ....

[Henri K.]

 

[Phacochère]

Il y a 3 heures, Akhilleus a dit :

...Cela dit je resterais prudent, les essais ne portent que sur 100 patients (on peut imaginer 50 en cohorte témoin) .....

Pas familier des études epidios, J'ai trouvé ca: https://fr.m.wikipedia.org/wiki/Étude_cas-témoins

On fait deux fois un test sur 2 groupes differents (soit 2 groupes de 50) pour confirmer ou c'est plus complexe ? (Comme en sociologie ) 

Modifié le 26 février 2020 par Phacochère
Forme

[BPCs]

Il y a 5 heures, Akhilleus a dit :

Le lien vers l'article

https://www.jstage.jst.go.jp/article/bst/advpub/0/advpub_2020.01047/_pdf/-char/en

 

Cela dit je resterais prudent, les essais ne portent que sur 100 patients (on peut imaginer 50 en cohorte témoin) .....

Mais on peut se raccrocher à ce qu'on a ....

En fait cet article est une simple lettre sans aucune donnée statistique et seulement une phrase disant que la chloroquine  a été supérieure au best médical treatment   

C'est léger pour se faire une idée de l'efficacité réelle du traitement...

il y a une heure, Phacochère a dit :

On fait deux fois un test sur 2 groupes differents (soit 2 groupes de 50) pour confirmer ou c'est plus complexe ? (Comme en sociologie ) 

On regarde si les résultats pour le groupe testé sont vraiment différents de ceux du groupe de référence ou témoin.

On calcule si la différence de résultat est supérieure à l'effet du hasard et pas due à des facteurs de confusion.

Et cela doit se traduire par une valeur numériquement significative.

Modifié le 26 février 2020 par BPCs

[BPCs]

Il y a 1 heure, Henri K. a dit :

 

Et les  chinois ont bossé comme des malades : 103 publications en très peu de temps répondant à Covid-19 sur les basses de données !

[Phacochère]

@BPCs, cela a-t-il un rapport avec l'écart type ? 

[BPCs]

il y a 14 minutes, Phacochère a dit :

@BPCs, cela a-t-il un rapport avec l'écart type ? 

Ça dépend de la méthode statistique utilisée : dans une comparaison de groupes on peut les caracteriser à partir de leurs moyennes et leurs écart-type respectifs et calculer si la différence montre un écart statistiquement significatif.

Ex d'un test utilisé : 

http://www.sthda.com/french/wiki/test-de-student-formules

Modifié le 26 février 2020 par BPCs

[Phacochère]

il y a 25 minutes, BPCs a dit :

Ça dépend de la méthode statistique utilisée : dans une comparaison de groupes on peut les caracteriser à partir de leurs moyennes et leurs écart-type respectifs et calculer si la différence montre un écart statistiquement significatif.

4 heures de statistiques tous les lundis matins, avec un prof monocorde m'ont rebutées.

Comme tu le rappels tout est question de méthode, encore fallait-il persévérer...

Cela dit, j'ai fais 100% avec ma voisine de droite. Là, j'ai plus progressé sur la notion de géométrie... et ses formes

Edit: j'ai beau être inconstant, je rattrape mon retard. http://www.sthda.com/french/wiki/test-de-student-formules

Modifié le 26 février 2020 par Phacochère
Syntaxe

[P4]

Quote

 

à 20:05

Le service de réanimation de l'hôpital de Creil fermé pendant 14 jours

Le service de réanimation de Creil est fermé pour les 14 prochains jours pour prévenir les risques de propagation du coronavirus, a appris France 2. Le patient décédé la nuit dernière, un enseignant de l'Oise, l'avait fréquenté pendant six jours. 

 

source: fil corona du fig

@Alexis

[Akhilleus]

Il y a 1 heure, BPCs a dit :

En fait cet article est une simple lettre sans aucune donnée statistique et seulement une phrase disant que la chloroquine  a été supérieure au best médical treatment   

C'est léger pour se faire une idée de l'efficacité réelle du traitement...

On regarde si les résultats pour le groupe testé sont vraiment différents de ceux du groupe de référence ou témoin.

On calcule si la différence de résultat est supérieure à l'effet du hasard et pas due à des facteurs de confusion.

Et cela doit se traduire par une valeur numériquement significative.

Je suis d'accord sur le côté "lettre". Cela dit il n'est pas completement inhabituel d'avoir des recommandations de protocoles de prise en charge avant que des resultats d'etudes multicentriques soient publiés en bonne et due forme. Les cliniciens ont en general la primeur des resultats avant la communauté scientifique generale en particulier dans des secteurs ou la crise est aigue (resistance aux traitements, protocole induisant moins de morbidité et ici nouvel agent pathogene)

C'est le seul caw que je connaisse ou pour une fois le politique/decisionnaire va preempter le scientifique

[BPCs]

Il y a 8 heures, Akhilleus a dit :

Je suis d'accord sur le côté "lettre". Cela dit il n'est pas completement inhabituel d'avoir des recommandations de protocoles de prise en charge avant que des resultats d'etudes multicentriques soient publiés en bonne et due forme. Les cliniciens ont en general la primeur des resultats avant la communauté scientifique generale en particulier dans des secteurs ou la crise est aigue (resistance aux traitements, protocole induisant moins de morbidité et ici nouvel agent pathogene)

C'est le seul cas que je connaisse où pour une fois le politique/decisionnaire va preempter le scientifique

On peut penser que les chinois qui ont pondu une conférence de consensus ont eu les diapo avec les valeurs pendant celle-ci.

Habituellement, même avec une étude-pilote les données ne sont pas publiées si vite. 

Ceci dit, en l'absence de données quantifiées, on ne peut pas éliminer même une option antipanique...car justement l'article est en voie de publication

Modifié le 27 février 2020 par BPCs

[P4]

Quote

Quelque 364 étudiants de différents campus de Sciences Po, sur un total de 14.000, doivent rester à leur domicile depuis lundi et pour 14 jours, après avoir voyagé dans des pays touchés par le nouveau coronavirus, selon l'institution.

.........

Le ministère de l'Éducation n'a pas de chiffre global sur le nombre d'élèves et de professeurs qui ont été priés lundi par les autorités de rester chez eux durant 14 jours parce qu'ils revenaient d'une des zones touchées par le virus.

 

https://www.lefigaro.fr/coronavirus-364-etudiants-de-sciences-po-isoles-a-domicile-20200227

 

Creil, la suite.

Quote

Environ 200 agents hospitaliers de Creil et Compiègne confinés chez eux

Environ 200 agents hospitaliers travaillant dans les hôpitaux de Creil et Compiègne (Oise), où ont séjourné cette semaine deux patients infectés par le coronavirus, sont confinés chez eux par mesure de précaution, a-t-on appris auprès de la CGT et du maire de Compiègne.
 

A l'hôpital de Creil - qui a pris en charge pendant six jours l'enseignant de 60 ans décédé dans la nuit de mardi à mercredi - une trentaine d'infirmiers, 24 aides-soignants, 15 médecins, des agents d'entretien, deux équipes du Smur qui ont géré le patient au service de réanimation et quatre agents des urgences qui seraient passés d'un service à l'autre doivent rester chez eux pendant 14 jours, a indiqué à l'AFP Corinne Delys, secrétaire générale de la CGT de l'établissement. «90% du personnel de réanimation, qui compte 15 lits, est confiné», a-t-elle affirmé.

L'un des deux patients est un personnel civil de la base de Creil.

 

Modifié le 27 février 2020 par P4

[P4]

D'un jour l'autre.

Quote

Douze cas diagnostiqués dans l'Oise, dont trois dans une base militaire

Le ministre a assuré que douze cas ont été diagnostiqués dans l'Oise. Parmi ces douze nouveaux cas identifiés en France, trois l'ont été dans une base militaire. «Une équipe se rendra sur place demain pour mener des investigations», a ajouté Olivier Véran. 

Parmi ces nouveaux cas, deux personnes sont hospitalisées dans un état grave. Ils revenaient d'un voyage en groupe en Egypte. «Nous sommes préparés à une épidémie», a encore assuré Olivier Véran.

 

[Wallaby]

Le 25/02/2020 à 11:27, Akhilleus a dit :

on passera en phase printanière/estivale (avec réduction mécanique du nombre de contamination)

Est-ce que quelqu'un connaitrait les grandes lignes de l'explication scientifique qui permet d'expliquer pourquoi certains virus ont une saisonnalité. J'ai essayé de lire des articles sur le sujet, sur Wikipédia ou autre, et je n'ai pas trouvé cela très clair.

[kalligator]

D'autant plus que je croyais que le froid inactivait ces bestioles et que le chaud leur permettait de se répliquer plus rapidement...après il y a l'état des voies respiratoires, mise à rude épreuve en hivers, irritées et soumises au stress du froid donc vraisemblablement plus sensible aux agent pathogènes...