Coronavirus - Covid 19

[christophe 38]

il y a 22 minutes, nemo a dit :

Une étudiante en médecine qui raconte son expérience de ces dernières semaines en BD. Emouvant.

https://www.lemonde.fr/blog/lavventura/2020/04/23/il-faudrait-dire-la-verite-une-etudiante-en-medecine-face-au-covid/

merci !!

[loki]

New York State Governor Cuomo said that preliminary findings from an antibody study conducted on 3,000 people at grocery stores across New York State found a 13.9% had coronavirus antibodies, suggesting a 13.9% actual infection rate statewide (21.2% in New York City), which translates to an estimate of about 2,700,000 actual cases in New York State (10 times more than the about 270,000 cases that have been detected and reported officially). Governor Cuomo acknowledged that the official count reported by New York State (which still is not including probable deaths as recommended by the new CDC guidelines) of about 15,500 deaths is "not accurate" as it doesn't account for stay at home deaths. Based on Worldometer's count (which includes probable deaths reported by New York City) of about 21,000 deaths and the 2,700,000 case estimate from the new antibody study, the actual case fatality rate in New York State could be at around 0.78%

https://www.worldometers.info/coronavirus/country/us/

[Henri K.]

il y a 12 minutes, Akhilleus a dit :

Vous vous rappelez de la manif anti confinement au Kentucky il y'a quelques jours ?

Bingo ca n'a pas raté  : https://www.iflscience.com/health-and-medicine/kentucky-sees-sharpest-rise-in-covid-19-cases-following-anti-lockdown-protests/?fbclid=IwAR0iAZwKfnFl0RB64I622TPpDVzr-1wIemdeNKsbJUTAj3Kq48idrJmmDW8

Darwin est toujours le plus fort quoiqu'on en dise .....

Quand on croit à la liberté mais pas à la science...

Un autre exemple, dans la Caroline du Nord :

Je leur souhaite "bon courage"... De toute façon on est trop nombreux sur terre...

Henri K.

P.S. Je vous propose un petit jeu de "Chercher l'erreur" sur la première photo. Même un peu bourré j'arrive à trouver au moins 5...

Modifié le 23 avril 2020 par Henri K.

[NUBEALTIUS]

https://www.sciencesetavenir.fr/sante/intox-la-bacterie-intestinale-prevotella-ne-joue-pas-de-role-dans-le-covid-19_143668

https://www.nouvelobs.com/coronavirus-de-wuhan/20200423.OBS27906/de-nouveaux-foyers-de-contamination-du-coronavirus-a-harbin-en-chine.html

[Snapcoke]

cela picole severe....

[Rufus Shinra]

[P4]

Quote

Echec d'un essai clinique de l'antiviral remdesivir contre le Covid-19

L'antiviral remdesivir du laboratoire américain Gilead Sciences a échoué à améliorer l'état de malades de Covid-19, maladie causée par le nouveau coronavirus, selon les résultats d'un des premiers essais cliniques sur le médicament en Chine et publiés prématurément, a rapporté jeudi le Financial Times.

Un résumé des résultats de l'essai clinique a été publié, avant d'être retiré, sur le site de l'Organisation mondiale de la Santé (OMS), d'après le quotidien britannique.

 

[Alexis]

Il y a 2 heures, Akhilleus a dit :

Vous vous rappelez de la manif anti confinement au Kentucky il y'a quelques jours ?

Bingo ca n'a pas raté  : https://www.iflscience.com/health-and-medicine/kentucky-sees-sharpest-rise-in-covid-19-cases-following-anti-lockdown-protests/?fbclid=IwAR0iAZwKfnFl0RB64I622TPpDVzr-1wIemdeNKsbJUTAj3Kq48idrJmmDW8

Darwin est toujours le plus fort quoiqu'on en dise .....

Cette manif était d'une stupidité remarquable, aucun doute là-dessus.

Cela dit, je me demande si le journaliste ne va pas un peu vite en besogne. On parle d'une manif qui a rassemblé "environ 100 personnes" et d'une augmentation journalière particulièrement élevée de + 273 contaminés.

Il n'est pas question de tout mettre sur le dos de la manif, quand même ?...

D'une part, j'ai quand même peine à croire que tous les manifestants auraient été contaminés. D'autre part, le nombre de contaminés nécessiterait de toute façon au moins un round supplémentaire de contamination, qu'on peut certes imaginer à partir des contaminés de la manif vers leurs familles - à supposer qu'ils n'aient pas manifesté en famille, évidemment ! Mais... la manif était le 15 avril. Il y aurait vraiment eu le temps pour un round supplémentaire de contamination de second degré et de déclenchement de symptômes ?

Cet article m'a en fait l'air d'un raccourci journalistique de plus :-( ...

 

Il y a 3 heures, Zalmox a dit :

Etude sur le cluster de Crépy-en-Valois 

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.18.20071134v1

Et une infographie en relation avec 

Révélation

 

Juste une remarque sur la comparaison fumeurs / non fumeurs. D'après leurs taux de contamination respectifs et le taux de contamination moyen, on peut déduire que les fumeurs devaient être environ 70 parmi les 661 personnes testées (je suppose 69 avec 5 contaminés parmi eux ce qui fait justement 7,2%)

Bon, ce serait intéressant d'avoir l'avis d'un statisticien (*) mais à vue de nez un échantillon de 69 ça paraît peut-être un peu léger pour rendre vraiment invraisemblable un simple effet du hasard. Si l'influence du tabac est en fait négligeable, on pouvait s'attendre à avoir environ 18 contaminés parmi les 69 fumeurs (taux moyen de 25,9%). N'en trouver que 5 est certes un peu surprenant, mais est-ce très surprenant ? Je n'en jurerais pas.

(*) C'est pourquoi je déclenche le signal d'appel de Batman :-) ===> @cracou !

Si Batman ne fréquentait pas ce forum, je dirais bien que l'écart-type d'une loi binomiale étant égal à la racine carrée du produit des probabilités "contaminé" et "non contaminé" et du nombre d'essais, il vient un écart-type de ( 69 * 0,259 * 0,741 )^0,5 = 3,6, donc une différence de 13 (entre 18 et 5) est effectivement significative étant supérieure à trois écart-types. Mais je ne suis pas sûr de ne pas oublier un truc et d'être du coup en train de me planter...

Bon reste de toute façon à vérifier si d'autres variables ne sont pas corrélées avec la consommation de tabac. Par exemple, si la plupart des contaminés sont en fait les lycéens eux-mêmes, il est permis de penser que justement la grande majorité d'entre eux ne fument pas, ce qui pourrait suffire à expliquer la corrélation entre tabac et absence de contamination :-D !

 

Il y a 4 heures, Wallaby a dit :

C'est à mettre à l'actif du bilan, mais il faudra aussi remplir la colonne passif du bilan avec la mortalité et la morbidité indirectes :

- - -

- - -

https://www.lest-eclair.fr/id146062/article/2020-04-20/nattendez-pas-pour-vous-faire-soigner (20 avril 2020)

Au plan national, les chiffres sont éloquents. Moins 60 % de consultations chez les spécialistes. Moins 40 % de consultations chez les généralistes et une forte baisse du dépistage de certains cancers et des vaccins pour les enfants, selon le ministère de la Santé.

La mortalité indirecte est certainement tout sauf négligeable, c'est clair. Mais elle n'est pas à porter au passif de la stratégie de confinement, parce qu'il faut parler aussi de la mortalité indirecte de l'alternative !

Non seulement les urgences non assurées à cause d'hôpitaux débordés, alors qu'elles le sont dans la période du confinement avec des hôpitaux suant sang et eau mais parvenant tout de même pour l'essentiel à tenir le front...

... Mais la mortalité indirecte de la crise économique encore plus profonde qu'aurait causé une stratégie de "on change pas grand chose, c'est l'immunité de groupe qu'il nous faut" !

Car il faut alors imaginer l'absentéisme au travail si des dizaines de milliers de personnes meurent en deux ou trois semaines, les médias sont pleins d'histoires d'horreur de la situation dans les hôpitaux, et beaucoup de gens connaissent un ami d'ami ou une connaissance un peu lointaine qui est hospitalisé voire mort - puisque leur nombre a tellement augmenté. Non seulement ça ne se bousculerait pas au portillon pour aller travailler, mais la suspension de nombreuses activités économiques pour cause d'absentéisme toucherait aussi les secteurs essentiels qui n'ont pas été interrompus pendant le confinement tels alimentation, santé...

Les dégâts à tous égards de cette crise économique là auraient été encore plus graves que ceux de la crise économique qui est sur nous.

[Fusilier]

il y a 21 minutes, Alexis a dit :

mais à vue de nez un échantillon de 69 ça paraît peut-être un peu léger

Il semble que cela a été constaté par beaucoup de soignants un peu partout . Une étude en Chine portant sur 1000 personnes infectées , ils ont trouvé 12,6 %   alors que le tx fumeurs en Chine est de 28% .  Sur 11 000 patients des HP, 8,5 % fumeurs  alors que le tx en France est de 25,4

Modifié le 23 avril 2020 par Fusilier

[Wallaby]

il y a 19 minutes, Alexis a dit :

Non seulement ça ne se bousculerait pas au portillon pour aller travailler, mais la suspension de nombreuses activités économiques pour cause d'absentéisme toucherait aussi les secteurs essentiels qui n'ont pas été interrompus pendant le confinement tels alimentation, santé...

Mais si les gens ne se bousculent pas au portillon pour aller travailler, alors ça veut dire... qu'ils sont confinés.

Mais si ils sont confinés, alors le taux de reproduction de la maladie diminue et l'épidémie diminue en intensité...

Donc en fait je crois qu'il faudrait comparer un scénario A au scénario B, bilan contre bilan et non pas seulement actif contre actif. Ou passif contre passif.

Le problème c'est qu'il n'y a qu'un seul scénario qu'on connait, ou plutôt que les historiens du futur connaitront assez bien : celui qui s'est réellement passé. Pour tous les autres scénarii imaginaires, on risque d'avoir une montagnes d'hypothèses assez difficiles à rendre cohérentes et à chiffrer.

[TarpTent]

Il y a 3 heures, Akhilleus a dit :

Vous vous rappelez de la manif anti confinement au Kentucky il y'a quelques jours ?

Bingo ca n'a pas raté  : https://www.iflscience.com/health-and-medicine/kentucky-sees-sharpest-rise-in-covid-19-cases-following-anti-lockdown-protests/?fbclid=IwAR0iAZwKfnFl0RB64I622TPpDVzr-1wIemdeNKsbJUTAj3Kq48idrJmmDW8

Darwin est toujours le plus fort quoiqu'on en dise .....

Moi ce qui m’embête, c’est qu’on ne pourra pas leur dėcerner un Darwin Awards global, pour l’ensemble de leur oeuvre.
Les Darwin Awards sont spécifiquement réservés à ceux n’ayant pas encore procréé. Du coup on va devoir en exclure certains voire de nombreux de ce prix honorifique, et c’est bien dommage.

[cracou]

il y a une heure, Alexis a dit :

uste une remarque sur la comparaison fumeurs / non fumeurs. D'après leurs taux de contamination respectifs et le taux de contamination moyen, on peut déduire que les fumeurs devaient être environ 70 parmi les 661 personnes testées (je suppose 69 avec 5 contaminés parmi eux ce qui fait justement 7,2%)

Bon, ce serait intéressant d'avoir l'avis d'un statisticien (*) mais à vue de nez un échantillon de 69 ça paraît peut-être un peu léger pour rendre vraiment invraisemblable un simple effet du hasard. Si l'influence du tabac est en fait négligeable, on pouvait s'attendre à avoir environ 18 contaminés parmi les 69 fumeurs (taux moyen de 25,9%). N'en trouver que 5 est certes un peu surprenant, mais est-ce très surprenant ? Je n'en jurerais pas.

(*) C'est pourquoi je déclenche le signal d'appel de Batman :-) ===> @cracou !

Si Batman ne fréquentait pas ce forum, je dirais bien que l'écart-type d'une loi binomiale étant égal à la racine carrée du produit des probabilités "contaminé" et "non contaminé" et du nombre d'essais, il vient un écart-type de ( 69 * 0,259 * 0,741 )^0,5 = 3,6, donc une différence de 13 (entre 18 et 5) est effectivement significative étant supérieure à trois écart-types. Mais je ne suis pas sûr de ne pas oublier un truc et d'être du coup en train de me planter...

Bon reste de toute façon à vérifier si d'autres variables ne sont pas corrélées avec la consommation de tabac. Par exemple, si la plupart des contaminés sont en fait les lycéens eux-mêmes, il est permis de penser que justement la grande majorité d'entre eux ne fument pas, ce qui pourrait suffire à expliquer la corrélation entre tabac et absence de contamination :-D !

Gnahaannaaaahganaaa, je sors de mon caveau

Alors on va le faire proprement. Ce qu'on veut est comparer deux fréquences, ou plus exactement un tableau à 4 cases.

Je ne reprends pas les chiffres

                  fumeurs                  non fumeurs

contaminés     400?                 69       

non conta           100?                        5

Alors pour comparer ces valeurs on peut utiliser

• -la comparaison des proportions.
•  faire un test du chi² pour vérifier si les deux variables sont dépendantes ou pas (et ta proposition de la loi binomiale est vaguement criminelle car elle sert à comparer une proportion à une situation exogène fixe or là la question est "est ce que le fait de fumer est lié ou pas à la contamination".
•  calculer le odd ratio ou rapport des cotes. https://fr.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio Le problème du odd ratio c'est qu'il est merdouilleux à expliquer simplement mais en gris s'il est supéieur à 1 le groupe du vnominateur a plus de risque d'avoir la pathologie que l'autre.
• une régression logistique qui est bien vplus tendue à expliquer mais qui permet de prendre en cause de multiples facteurs qualitatifs.

Les auteurs disent "The infection attack rate(IAR)was defined as the proportion of all participants with confirmed SARS-CoV-2 infectionbased on antibody detection. It was comparedby age, sex, occupation, smoking, comorbid conditions and recent symptomsusing chi-squared test.Logistic regression was used toadjust for age oroccupation when analysingthe association between smoking and SARS-CoV-2infection.

Leur calcul sur les effectifs est valide (taille d'échantillon théorique >5 par case) et la régression logistique est légitime. Il y a effectivement un risque moindre d'avoir le virus si on fule, même si on prend en compte l'a^ge et le métier MAIS MAIS MAIS ils n'ont pu vérifier que ces éléments et on ne sait pas si la répartition des fumeurs était uniforme. En gros si les fumeurs sont des gros branleurs qui sèchent alors ils n'ont pas été contaminés non pas parce qu'"ils fument mais parce que ce sont des fumistes. Et là on ne sait pas exactement ce qui s'est passé. L'échantillon est trop petit pour évacuer ce genre de risques liés à une diffusion en cluster totalement farfelue. Par exemple si le truc contamine un groupe de mes étudiants, en fonction du groupe contaminé tu auras des valeurs totalement différentes.

Note: le odd ratio c'est le rapport des risques et PAS le risque relatif. Trop tard pour expliquer. https://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio

 

Modifié le 23 avril 2020 par cracou

[Snapcoke]

Lors de la conférence de presse qui se tient à cet instant, Trump nous fait son charabia habituel sur toutes les conneries qu'on peut imaginer (tout va bien, tout n'a jamais été aussi bien, le virus c'est bientôt de l'histoire ancienne, blablabla).

Problème :

Quelques minutes après, le responsable scientifique de la Maison-Blanche prend la parole et nous explique que le virus meurt en quelques minutes en plein soleil (bombardé d'UV) et en quelques secondes avec l'isopropanol (alcool de désinfection).

Trump le laisse finir puis prend la parole. 

... et nous explique qu'il a eu une idée révolutionnaire. 

Il va demander aux scientifiques d'étudier la possibilité, je cite : 

"D'infiltrer des rayons UV dans les corps des gens pour tuer le virus, avec des lampes ou des trucs comme ça..." et aussi de voir s'il serait possible d'étudier l'idée "d'injecter du désinfectant dans les gens pour tuer le virus"...

Je vous jure que c'est vrai. Gros malaise dans la salle devant un scientifique gêné hors caméra qui ne répond pas à Trump.

Un journaliste pose la question quelques minutes plus tard, le scientifique esquive avec un "hmmm, on ne fait pas ça dans notre labo..." et prend la fuite pour ne pas en rajouter une couche.

Magnifique.

 

Il vient d'en rajouter une couche auprès de la médecin en charge de la Task Force et a créé un nouveau malaise. 

C'est dingue...

[fool]

Moi je sais pas ce qu'il vous faut, le gars Trump pris d'une fulgurance cognitive t'invente le concept de la Radiothérapie ET  de la Chimio en moins d'une minute et ça ne vous impressionne toujours pas ....imaginez de quoi il serait capable s'il n'était pas aussi stable 

Modifié le 23 avril 2020 par fool

[pascal]

Relisez Dead Zone de Stephen King c'est d'une actualité brulante

[wielingen1991]

 

[DrWho]

Carte des médecins contaminés ( à noter la région de Bordeaux et Nantes (malades déplacés alors que région moins touchée ?)

https://www.lequotidiendumedecin.fr/actus-medicales/sante-publique/covid-19-la-carte-de-france-des-medecins-contamines

(attention c'est un sondage volontaire )

il y a 11 minutes, wielingen1991 a dit :

 

si on ramène la létalité à la population totale on a

0.03 % France

0.2 % Suède..c'est pas pareil ! je rejoins HenryK pour ce genre de journalisme

Modifié le 24 avril 2020 par DrWho

[Fusilier]

il y a 15 minutes, DrWho a dit :

à noter la région de Bordeaux et Nantes (malades déplacés alors que région moins touchée ?)

volontaires qui sont allés dans l'Est et région parisienne ? 

[Zalmox]

il y a 18 minutes, DrWho a dit :

Carte des médecins contaminés ( à noter la région de Bordeaux et Nantes (malades déplacés alors que région moins touchée ?)

https://www.lequotidiendumedecin.fr/actus-medicales/sante-publique/covid-19-la-carte-de-france-des-medecins-contamines

(attention c'est un sondage volontaire )

si on ramène la létalité à la population totale on a

0.03 % France

0.2 % Suède..c'est pas pareil ! je rejoins HenryK pour ce genre de journalisme

Je crois qu'il y ait erreur votre honneur

Ce matin https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries donne la France à 335 morts/million population et la Suède à 200, soit 0,02%. Seulement 10 fois moins que votre taux.

 

[DrWho]

il y a 7 minutes, Zalmox a dit :

Je crois qu'il y ait erreur votre honneur

Ce matin https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries donne la France à 335 morts/million population et la Suède à 200, soit 0,02%. Seulement 10 fois moins que votre taux.

 

honte à moi ,j'ai fait disparaitre les indices ,comme dans House of cards 

par contre ils ont un peu de retard en jours

mais je l'ai dit souvent au bout de plusieurs mois je pense qu on aura tous un taux assez semblable dans tous les pays europeens

[mayamac]

il y a 11 minutes, Zalmox a dit :

Je crois qu'il y ait erreur votre honneur

Ce matin https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries donne la France à 335 morts/million population et la Suède à 200, soit 0,02%. Seulement 10 fois moins que votre taux.

 

je confirme, selon l'ECDC (merci @Gally)

au 23 avril :

France : 31.8 décès pour 100 000 habts

Suede : 19.0 décès pour 100 000 habts.

C'est un même ordre de grandeur pour moi

Edit : après, comparaison n'est pas raison, il semble y avoir tellement de facteur influent la pandémie : us et coutume du pays, densité, interaction sociales, génétique, climat,.....

Modifié le 24 avril 2020 par mayamac
complement

[FATac]

il y a 30 minutes, DrWho a dit :

Carte des médecins contaminés ( à noter la région de Bordeaux et Nantes (malades déplacés alors que région moins touchée ?)

https://www.lequotidiendumedecin.fr/actus-medicales/sante-publique/covid-19-la-carte-de-france-des-medecins-contamines

 

il y a 12 minutes, Fusilier a dit :

volontaires qui sont allés dans l'Est et région parisienne ? 

Plein d'options possibles ...

Plus de disponibilité dans l'Ouest que dans l'Est et en RP pour répondre au questionnaire, et donc sur-représentation de ceux qui ne sont pas "la tête sous l'eau" ?

Moindres protections et moindre niveau de vigilance dans les régions les moins touchées, sans cluster alertant les praticiens et leur faisant prendre davantage de précautions ?

Arrivée plus tardive de la pandémie dans ces régions, avec un recours plus important à la médecine de ville (malgré les consignes "appelez le 15") par peur d'aller aux urgences, de braver le confinement ou tout autre fantasme irraisonné poussant à se "rassurer" avec le praticien que l'on connait quand on a des symptômes ?

Mouvements de personnels soignants, comme le souligne @Fusilier (plus probable à mes yeux que la contamination par mouvement/transfert de malades en décharge des hôpitaux de l'Est évoquée par @DrWho) ?

Et il y en a certainement d'autres ... Densité de population ? Mouvements de population ? Densité de personnels soignants ? etc.

[pascal]

il y a 3 minutes, DrWho a dit :

honte à moi ,j'ai fait disparaitre les indices ,comme dans House of cards 

par contre ils ont un peu de retard en jours

mais je l'ai dit souvent au bout de plusieurs mois je pense qu on aura tous un taux assez semblable dans tous les pays europeens

C'est à la fin de la foire qu'on compte les bouses ...

Un cluster dont on parle peu mais qui m'a été rappelé les stations de ski des Savoies durant les vacances de février

[Delbareth]

il y a 5 minutes, DrWho a dit :

honte à moi ,j'ai fait disparaitre les indices ,comme dans House of cards 

par contre ils ont un peu de retard en jours

mais je l'ai dit souvent au bout de plusieurs mois je pense qu on aura tous un taux assez semblable dans tous les pays europeens

Moi ce qui m'interroge c'est leur taux de mortalité (cf graphique ci-dessous, données OMS, France : hôpitaux seulement)

Je m'explique.

Ce taux de mortalité est défini comme le rapport de deux nombres (décès et cas confirmés) qui sont pas forcément comptés de la même manière dans chaque pays. Ce qu'on remarque, c'est qu'à mesure que progresse l'épidémie, ce taux augmente, très certainement par la moindre détection des cas que par une réelle hausse des décès.

Le taux de mortalité très fort - en augmentation significative - ajouté au fait qu'ils ont une semaine de retard par rapport à nous, me fait penser qu'ils sous-testent significativement.

Or le nombre de cas est quand même le premier truc qui diverge, le nombre de morts vient ensuite. J'ai peur que leur solution "à la suédoise", ce soit surtout de se mettre la tête dans le sable.

[mayamac]

et toujours les courbes de l'Allemagne très faibles...